北京市畜禽健康养殖环境工程技术研究中心依托于中国农业大学农业生物环境与能源工程国家重点学科，涉及农业生物、建筑与环境工程以及新能源工程等新兴交叉学科，是现代畜牧业发展的重要支柱学科。中心围绕北京都市型现代畜禽种业发展战略及畜产品安全供给的工程技术支撑需求，重点开展都市型畜牧业健康养殖模式研究与创新、畜禽健康养殖环境净化与调控和畜禽健康养殖低碳节能设施与装备等方面的研究工作。 工程中心在2017年初完成的绩效考评中被评为“优秀”，北京市国际科技合作基地在2018年初进行的评估中被评为“优秀”。